Du court métrage, au clip vidéo (notamment pour Gossip), en passant par le montage, Justin Kelly a grimpé les échelons avant de réaliser I Am Michael en 2015. Le long métrage suit le voyage intérieur d’un activiste homosexuel qui renonce à sa sexualité pour devenir pasteur conservateur. Avec James Franco, Emma Roberts, Zachary Quinto, cette production américaine a beaucoup fait parler d’elle.
En 2016, le cinéaste poursuit sa collaboration avec James Franco et réalise King Cobra, une sordide histoire de meurtre dans les coulisses du porno gay, avec notamment Christian Slater. Le film connaît une carrière essentiellement en vidéo et VOD, et parcourt les festivals LGBT de la planète.
L’auteur réalise ensuite Welcome the Stranger, avec Abbey Lee, Caleb Landry Jones et Riley Keough. Le film sort en VOD. En 2018, Justin Kelly passe à la vitesse supérieure avec J.T. LeRoy, biopic distribué aux USA par Universal Pictures. La production avec Kristen Stewart, Laura Dern et Jim Sturgess, clôt le festival de Toronto en 2018, sans susciter plus d’enthousiasme que le phénomène J.T. LeRoy aurait pu laisser espérer après la controverse des années 2000.